Sejarah Madrasah
MAN 2 Kota Bengkulu awalnya adalah kelas jarak jauh dari MAN 1 Model Bengkulu yang beralamat di Jalan Cimanuk Km. 6,5 dan memiliki kelebihan siswa. Sedangkan bangunan yang ada tidak mencukupi kapasitas siswa yang masuk, dan untuk membangun gedung kembali arealnya sudah sangat sempit. Ini mendorong Kepala Sekolah yang menjabat waktu itu beserta komite dan masyarakat mendirikan bangunan baru. Dipilihlah daerah yang masih sangat luas yaitu Padang Kemiling Kel. Pekan Sabtu Kec. Selebar Kota Bengkulu.
Alasan dipilihnya daerah itu dikarenakan wilayahnya masih luas dan dekat dengan pemukiman penduduk, serta dekat dengan sarana transportasi baik darat maupun udara. Saat itu bangunan yang ada hanya Gedung Ruang Belajar, Kantor, Perpustkaan dan Laboratorium Fisika. Pada akhir Desember 2003 terjadilah proses penegerian, dengan jumlah murid 120 siswa dan tenaga pendidik sebanyak 12 orang.
Pada tanggal, 12 Maret 2004 terjadi pergantian Kepala Madrasah dari Ibu Dra. Hj. Miswati Natalia ke Bapak Drs. Mulya Hudori. Kemudian pada tanggal 23 Maret 2007 terjadi pergantian kepala madrasah yang dijabat oleh Bapak Drs. Misrip, M. Pd. Dibawah kepemimpinan beliau , Madrasah Aliyah Negeri 2 Kota Bengkulu sudah semakin maju. Selanjutnya, kembali terjadi pergantian kepala madrasah pada tanggal 20 Januari 2014 yang di jabat oleh Ibu Dra. Hj. Miswati Natalia, MM. Dibawah kepemimpinan beliau Madrasah Aliyah Negeri 2 Kota Bengkulu semakin maju dan akan melangkah menuju Sekolah Peduli dan Berbudaya Lingkungan (Adiwiyata Mandiri).
Sehubungan dengan Kepala MAN 2 Kota Bengkulu telah Purna Bakti maka pada tanggal 12 Pebruari 2018 dilantik kepala madrasah baru yang di jabat oleh Ibu Karmila, S. Ag., M. Pd, beliau berkomitmen dibawah kepemimpinan beliau Madrasah Aliyah Negeri 2 Kota Bengkulu akan lebih maju lagi sehingga dapat lebih dikenal oleh masyarakat. Hal ini terbukti dibawah kepemimpinan beliau MAN 2 menjadi lebih berprestasi baik dari segi bidang akademik maupun non akademik. Sehingga MAN 2 Kota Bengkulu sudah diperhitungkan oleh sekolah umum lainnya, baik di kota maupun provinsi dalam segala kegiatan. Dan telah mengantarkan MAN 2 Kota Bengkulu menjadi Sekolah Peduli Anak dan Berbudaya Lingkungan (Adiwiyata).